Oldukça eski bir kent olan Yüksekova'da yerleşimin M.Ö. 7000'lere kadar dayandığı kesin olarak bilinmektedir. M.Ö. 1000'de ise yörede Urartular yaşamıştır. Kanuni devrinde Osmanlı hâkimiyetine giren kentin eski adı Gever'dir.

Şehir, I. Dünya Savaşı sırasında Rus işgaline uğramışsa da 5 Mayıs 1918'de Rus işgalinden kurtulmuştur. 19. yüzyıl'da Van Vilayeti'ne bağlı Hakkâri Livasının kazası olan Yüksekova, 1936'da ilçe durumuna getirilmiştir. İlçe merkezin eski adı o yıllardaki ismi ise Dize'dir.

Yüksekova, Doğu Anadolu Bölgesi'nin Hakkâri bölümünde bulunmaktadır. Yüksekova ilçesinin çevresinde Başkale ilçesi, İran, Irak ve Hakkâri merkez ilçesi yer almaktadır. Yüksekova, dağlar arasında çöküntü bir alanda kurulmuştur.  Ovanın yükseltisi 2 km ye yakın olup en boyu 15 km uzunluğu ise 40 km dir.